目前，食品廢水的處理方法主要物理化學法、生物化學法，具體如下：

 1. 物理處理法物理處理法是指應用物理作用改變廢水成分的處理方法。用于食品工業廢水處理的物理處理法有篩濾、撇除、調節、沉淀、氣浮、離心分離、過濾、微濾等。

（1）格柵攔截較粗的懸浮固體，其作用是保護水泵和后續處理設備。格篩常用的孔徑是10—40目。

（2）撇除某些食品工業廢水中含有大量的油脂，隔油池對漂浮狀油脂的去處率可達90%以上。對小型處理系統，可設油水分離器撇油。

（3）設置調節池對廢水的水質和水量進行調節

（4）沉淀沉淀是用來除去原廢水中無機固體物和有機固體物，以及分離生物處理工藝中的固相和液相。用沉砂池除去原廢水中的無機固體物；用初沉池除去原廢水中的有機固體物；用二沉池分離生物處理工藝中的生物相和液相，為了提高沉淀池的沉淀效率，可在沉淀池內設置平行的斜板或斜管而成斜板（管）沉淀池。一般沉淀時間1.5—2.0h。

（5）氣浮氣浮主要用于除去食品工業廢水中的乳化油、表面活性物質和其他懸浮固體。氣浮可除去90%以上的油脂和40%—80%的BOD和SS。氣浮池HRT一般30min。

2. 化學處理法化學處理法是指應用化學原理和化學作用將廢水中的污染物成分轉化為無害物質，使廢水得到凈化，有中和、混凝、電解、氧化還原、離子交換、膜分離法等方法。

3. 生物處理法生物化學處理法是有機廢水處理系統中重要的過程之一。在食品工業的廢水處理中，生物處理工藝可分為好氧工藝、厭氧工藝、穩定塘、土地處理以及各種組合工藝。食品廢水是有機廢水，生物法是主要的二級處理工藝，目的在于降解COD、BOD。好氧生物處理工藝根據所利用的微生物的生長形式分為活性污泥工藝和膜法工藝。前者包括傳統活性污泥法、階段曝氣法、生物吸附法、混合法、曝氣法、氧化溝、間歇活性污泥法（SBR）等。后者包括生物濾池、塔式生物濾池、生物轉盤、活性生物濾池、生物接觸氧化法、好氧流化床等。一般好氧處理對低濃度廢水效果較好。厭氧生物處理工藝適用于食品工業廢水，主要原因是廢水中含易生物降解的高濃度有機物。此外，厭氧處理動力消耗低，產生的沼氣可作為能源，生成的剩余污泥量少，厭氧處理系統全部密閉，利于改善環境衛生，可以季節性或間歇性運轉，污泥可長期儲存。